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营业执照降低注册资金的流程因地区和企业类型而异，但大致的操作流程如下。
1、召开股东会，形成股东会决议，决议内容包括减少注册资本的数额、时间等事项，同时修改公司章程，并需要股东签字确认。
2、向当地市场监督管理局提交相关材料，包括股东会决议、营业执照等必要文件，填写公司变更申请表，并准备相关材料。
3、市场监督管理局审核通过后，会发放准予变更登记通知书，此时需要缴纳变更登记费用。
4、在拿到准予变更登记通知书后，就可以去工商局办理营业执照的变更手续了，同时还需要去税务局办理税务登记证变更手续。
5、完成上述步骤后，等待工商局审核通过并领取新的营业执照，此时公司已经完成了注册资金的降低。
需要注意的是，不同地区的具体操作流程可能有所不同，建议在实际操作时咨询当地的市场监督管理局或相关部门的工作人员，降低注册资金涉及到公司的稳定性和信誉度问题，需要谨慎考虑并合法合规操作。